河道总督左光斗和幕僚徐霞客在治水上首先进行了导黄入海的工程。左光斗给皇帝写了一封奏章说明导黄入海的好处，皇帝给予了大力支持。

徐霞客认为：治水必始自下游，下游疏通则上流自然不会饱涨泛溢。如果不疏通淤塞的下游河道，一旦上流决口全部堵塞，大水全部下注，仍会因下游不通而无处可去、四处溃决、泛滥横流。因此他们把疏通自清江浦以下、历经云梯关、直达海口的下游河段以导黄入海列为大修方案的第一项。

海口，或称河口，是黄、淮二河合流入海之处。由于黄河含沙量大，泥沙受海潮顶托之力，大量淤积在河口，使河口扩展很快，陆地不断向海中延伸，从而使千百年来的海岸线变化很大。

云梯关是黄淮合流入海的河口处。左光斗和徐霞客通过调查得知：这段河道原先河身宽达一二里至四五里的地方现今只宽一二十丈，原来深达三五丈至五六丈的地方现今指深几尺。倘若不将其进行疏通，河水就无法顺畅的入海。

他们还发现：自万历后期以来，海口淤沙已经有十年之久，沙层十分坚硬，单独靠水力来冲刷是不可能的，而且很有可能导致河水不但无法冲刷掉泥沙，反而会冲垮堤岸的不良后果。因此，在这项工程中，他们采用了“疏筑结合”、“寓筑于浚”的方法，在自清江浦到云梯关这段河道上挑挖引河，同时以挖出的土筑成两岸的大堤。

所谓引河，又称引水河，是在河道上开挖的用以引导河水直流刷沙的人工河道。其方法是：在河身两旁离水三丈远的地方，各挖一条面宽八丈、底深两丈、深一丈二尺的引河，与原有河道平行成“川”字形。从引河中挖出的土，就近运到河边，筑成坚实的大堤。

这样，在原先狭窄的河身两旁的旧堤便被夹在引河与原河身之间，等上流决口尽堵、黄淮二水合流下注后，来势凶猛的河流受新筑大堤的束缚，便会顺着预挖的引河流往下游，而河身与引河间的旧堤受到水流自上而下和两侧面的三面夹攻，不久便会尽行刷去，然后旧有的河身与新挖的引河便会连为一体，直到冲刷得与引河差不多深。时日一久必会使河道刷深，河水畅流入海。

此外，自云梯关到海口一百多里长的河道是下游中的最下游，也是左光斗、徐霞客最为重视的地方。这段河道上，除了近海二十里因为时有海潮、泥土泥泞无法施工之外，其余八十多里河身淤积情形与云梯关内几乎一样。但因这儿靠海近，筑的堤只要能够拦水就可以了，不必像关内那样筑得又高又厚。

导黄入海工程从天启二年十一月开始动工。现在宽阔的河床，一眼望去，只见一片热火朝天的劳动景象，尽是忙忙碌碌紧张工作着的人群。炎炎烈日下，夫役手中被沙土磨得雪亮的工具反射一道道耀眼的银光。夫役们则光着膀子，脖子上搭着的毛巾早已被汗水浸透。负责从河道中往岸边运土的夫役推着吱呀吱呀响的独轮车来来往往，岸上负责夯筑的夫役则几个人一组，一边喊着号子，一边将重重的石硪一下一下地砸到倾倒下的新土上。

监管人员不时地大声吆喝、来往指挥监督。而身为河道最高指挥官——河道总督的左光斗也会带几个随从，不远百里来此视察工程进展情况；作为工程的实际策划者，徐霞客更是时刻关注着工程的进行，他有时指导夫役们如何按要求进行夯筑，有时拿了测量仪器独自下到河滩里探查地势、测量高低，有时则根据新出现的问题及时与左光斗商量对策，随时注意因地制宜地修正原有方案。

任何一个农耕民族的文化，都可以称之为水的文化。

不要以为水利事务纯是工程技术问题，在几乎没有什么事不和政治发生关系的中国，一个负责水利工程官员所遇到的障碍和困难是难以想象的。

权限、经费、劳力以及纠缠不清的人际关系，每一方面都足以让人寝食不安。但那些有事业心、能为民众考虑的官员，会勇于负起责任，冒风险，排阻力，以实现既定的目标。

这段日子可是把左光斗累坏了，他变得又黑又瘦，这些日子看河防，调度河工，和各衙门吏员整日磨嘴皮子打擂台，越发显得干瘪枯黄，熬得发黑的眼圈下皮松弛着，仿佛疲倦得一推倒就再也起不来，斜靠在椅背上一口接一口喝着浓酽的普洱茶。

河道总督的幕僚徐霞客在旁边也是茶水喝个没完，好在徐霞客常年在外旅行，打熬筋骨，他比河道总督要精神很多。

皇帝的拨款一下发，河防工程立刻大动起